AHF eröffnete im Februar 2002 in Zusammenarbeit mit dem ugandischen Gesundheitsministerium die erste AHF Uganda Cares Klinik im Distrikt Masaka und bot damit erstmals die Möglichkeit einer antiretroviralen Behandlung (ART) außerhalb der Hauptstadt Kampala in einer öffentlichen Gesundheitseinrichtung – dem Masaka Regional Referral Hospital.

 AHF Uganda Cares ist einer der größten Anbieter kostenloser HIV-Dienstleistungen im Land und bietet Prävention, Behandlung und Betreuung an. Das Modell, das die Öffentlichkeit, die Zivilgesellschaft und die lokale Bevölkerung einbezieht, wurde 2003 von der Weltgesundheitsorganisation (WHO) und UNAIDS als Best Practice für die antiretrovirale Therapie (ART) anerkannt. Dank der intensiven Unterstützung lokaler Organisationen halten sich 98 % der Klienten an ihren Behandlungsplan. Im Laufe der Jahre wurde das Programm auf 28 Distrikte ausgeweitet, darunter Rakai, wo 1980 der erste HIV-Fall in Uganda festgestellt wurde.

AHF Uganda Cares bietet landesweit über 148,600 Menschen kostenlose antiretrovirale Therapien (ART) sowie gezielte HIV-Tests und Beratungsdienste an, um gefährdete Bevölkerungsgruppen zu erreichen und positive Patienten mit der nötigen Betreuung zu verbinden. Präventionsmaßnahmen umfassen Kondomaufklärung, kostenlose Kondomverteilung und Safer-Sex-Werbung durch Aufklärungs- und Medienkampagnen.

In allen 64 von AHF unterstützten Gesundheitseinrichtungen sind HIV-Tests verfügbar. Ergänzend werden Infrastrukturverbesserungen vorgenommen, um den Klienten eine würdige Serviceumgebung zu bieten. Darüber hinaus engagiert sich AHF Uganda Cares für die Förderung des Zugangs zu Behandlungen, die Sicherung der Finanzierung der HIV-Bekämpfung, den Schutz der Rechte von Mädchen und die Betonung der Verwendung von Kondomen als wichtige HIV-Präventionsmethode.